Scapania aequiloba est typique des rochers calcaires de montagne, soit dans des coussins d'autres espèces, soit directement sur le rocher. Le spécimen présenté provient d'un schiste calcaire en forêt d'altitude dans le Vercors.
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Les tiges sont de taille moyenne (jusqu'à 4 cm de long et 1-3,5 mm de large) et de couleur verte à vert-brunâtre. Les deux lobes des feuilles sont souvent non superposés, ce qui donne un aspect hirsute aux tiges.
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Les feuilles sont caractéristiques du genre
Scapania, bilobées et condupliquées. Les amphigastres sont absent.
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Chez cette espèce, les deux lobes sont presque de même taille et ne sont pas décurrents. Le dorsal recoupe la tige. La marge est généralement entière.
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