amibes test pour mon équipement


Ciliés, Flagellés, Dinoflagellés, Amibes, etc ...

Règles du forum

Ciliés, Flagellés, Dinoflagellés, Amibes, etc ...
Avatar du membre
OlivierBarth
membre
membre
Messages : 630
Enregistré le : 06 oct. 2007 12:29
Prénom : Olivier

amibes test pour mon équipement

Message par OlivierBarth »

Bonjour à tous,
voici quelques images d'un sujet pas facile à imager en fond clair.
D'autant que les objectifs ne sont que de simples achromats et que la caméra est une petite "caméra oculaire" de 1.3 MP.
Calculs faits,elle sur-échantillonne:0.5 micron(c'est à dire en étant un peu optimiste,le pouvoir séparateur du X40) couvre 6 photosites en linéaire(taille du photosite:3.6x3.6 microns)
Assez bavardé,voilà le résultat:
amoeba_spastra1.jpg
amoeba_spastra1.jpg (95.64 Kio) Vu 3162 fois
mayorella_sp.jpg
mayorella_sp.jpg (105.71 Kio) Vu 3157 fois
saccamoeba2.jpg
saccamoeba2.jpg (93.95 Kio) Vu 3156 fois
vannella.jpg
vannella.jpg (102.17 Kio) Vu 3153 fois
microscope trinoculaire Swift, obj 4,10,20,40,100
caméra: 1.3 MP
Avatar du membre
OlivierBarth
membre
membre
Messages : 630
Enregistré le : 06 oct. 2007 12:29
Prénom : Olivier

Re: amibes test pour mon équipement

Message par OlivierBarth »

En me relisant, je vois qu'un paramètre est mal expliqué: 0.5 micron AVEC le X40 forme une image sur le capteur couvrant 6 photosites(plus communément mais de manière erronée appelés "pixels")
microscope trinoculaire Swift, obj 4,10,20,40,100
caméra: 1.3 MP
Avatar du membre
Daniel
membre
membre
Messages : 6104
Enregistré le : 27 sept. 2007 11:33
Prénom : Daniel
Localisation : Privas (Ardèche, France)
Contact :

Re: amibes test pour mon équipement

Message par Daniel »

OlivierBarth a écrit :En me relisant, je vois qu'un paramètre est mal expliqué: 0.5 micron AVEC le X40 forme une image sur le capteur couvrant 6 photosites(plus communément mais de manière erronée appelés "pixels")
Dans ta phrase, cela aurait pu être des photosites ou des pixels.

Il faut en effet bien retenir que le sens des 2 mots est différent.
Les pixels sont des éléments de l'image, les points de l'image affichée à l'échelle 1.
Et les photosites sont les constituants individuels des capteurs, qui permettent la mesure de la lumière pour chaque pixel.

La forme en étoile de la première amibe est étonnante...
Daniel Nardin
sites: perso, microscopie , plongée Egypte et Réunion, orchidées du Doubs
matériel micro/macro/photo principal: microscopes Olympus BH, stéréomicroscope Nikon SMZ, reflex Nikon (D800 actuellement) +105macro, soufflet... , hybride Olympus EM5 mkII, compact OlympusTG-5 ...
Avatar du membre
André
Coadmin
Coadmin
Messages : 12546
Enregistré le : 28 août 2007 23:12
Localisation : Citoyen du monde-Europe

Re: amibes test pour mon équipement

Message par André »

Bonjour à tous, Olivier

Je trouve les résultats du test amibes réussi !
La halo que l'on voit autour des amibes fait même penser à du contraste de phase !
Amicalement
André Advocat

Logiciels:Microcartouche outil indispensable développé par Christian Aubert,Photoshop,Neatimage,Helicon

Le Naturaliste...le forum le plus regardé dans les terriers!
michel17
membre
membre
Messages : 533
Enregistré le : 15 déc. 2018 11:03
Prénom : michel

Re: amibes test pour mon équipement

Message par michel17 »

Bonjour à tous
En ces temps ennuyeux prenons plaisir à pinailler un peu pour juger de l'adéquation entre la résolution de l'objectif et la taille des photosites... :) :) :)
La résolution , ou le pouvoir séparateur d'un objectif de 40x est de 0.5µM... sur l'objet examiné on distingue deux points distants de 0.5µm.
... "arrivé sur le capteur" ces deux point seront distants de 0.5x40 = 20µm , 40 étant le grossissement de l'objectif ( éventuellement multiplié par le grandissement du projectif ou de l'oculaire, s'il y en a un.)
Les photosites sont donnés pour 3.6µm , nos 20µm "s'étalerons donc" sur 20/3.6= 5.5 photosites... ce qui constitue un échantillonnage très satisfaisant.
Pour conclure, lorsque vous choisissez un capteur, c'est la taille des photosites qui importe et non leur nombre. La plupart des capteurs, photo ou caméra sont d'ailleurs satisfaisant sur ce point.
P.S. pour être parfaitement rigoureux il faudrait ensuite adapter le nombre de photosites pour couvrir le champ de l'image donnée par le microscope.
... voilà, il est content il dormira bien ce soir :D
Cordialement
Michel

Microscope: Olympus CX41.
Caméra TUCSEN Michrome 6MP
Avatar du membre
Jean-marc
membre
membre
Messages : 1382
Enregistré le : 19 juin 2010 10:48
Prénom : jean-marc
Localisation : Nantes

Re: amibes test pour mon équipement

Message par Jean-marc »

Hello,
michel17 a écrit : Pour conclure, lorsque vous choisissez un capteur, c'est la taille des photosites qui importe et non leur nombre. La plupart des capteurs, photo ou caméra sont d'ailleurs satisfaisant sur ce point.
P.S. pour être parfaitement rigoureux il faudrait ensuite adapter le nombre de photosites pour couvrir le champ de l'image donnée par le microscope.
... voilà, il est content il dormira bien ce soir :D
Salut Michel,
Je pense que tu voulais dire la taille des capteurs, pas celui des photosites ?
On peut très bien avoir des petits capteurs (1/2,5) avec beaucoup de petits photosites, 10 millions par exemple, et un projectif x0,33 - x0,5, ou bien un capteur APSC, de 15 millions de "grands" photosites avec un projectif de x1,6. Chaque couple couvrira sensiblement le champ complet.
La taille des photosites n'est importante que sur le bruit, la sensibilité, pas sur la résolution (dans une certaine limite évidemment)
L'important est d'avoir le couple capteur - projectif adapté au champ du microscope, au grossissement de l'objectif, et selon l'échantillonnage souhaité (strictement supérieur à 2)

A+

JM
Microscope Leitz Aristoplan, DIC, contraste de phase, fond noir, Fluorescence
http://www.lenaturaliste.net/forum/view ... lan#p54275
Éclairage diasc et épisc LED 20W + Flash électronique embarqué dans le statif commandé par Canon 600D
https://www.facebook.com/microscopie44/
https://www.instagram.com/microscopie_44/
https://www.youtube.com/channel/UCJyBt2 ... IjlcZXfNow
michel17
membre
membre
Messages : 533
Enregistré le : 15 déc. 2018 11:03
Prénom : michel

Re: amibes test pour mon équipement

Message par michel17 »

Bonjour Jean-Marc
Pour avoir un bon échantillonnage (supérieur à deux), par rapport au pouvoir séparateur de l'objectif, il faut bien se référer à la taille des photosites; mais je te l'accorde c'est toujours le cas, les 0.5µ sur l'objet un fois arrivés sur les photosites ont subit "l'agrandissement" du couple objectif-projectif ( ici rien que l'objectif donne 20µ).
Mais je pinaille... ;) et l'adéquation au champ est plus importante... via la taille du capteur et le projectif.
Cordialement
Michel

Microscope: Olympus CX41.
Caméra TUCSEN Michrome 6MP
JMP76
membre
membre
Messages : 1439
Enregistré le : 16 nov. 2011 17:19
Prénom : Jean-Marie
Contact :

Re: amibes test pour mon équipement

Message par JMP76 »

Bonjour à tous

Ce matin j'ai envie de taquiner Jean-Marc:
La taille des photosites n'est importante que sur le bruit, la sensibilité
Aussi surprenant que cela paraisse, la sensibilité (native) ne dépend pas de la taille (dimensions) des photo-sites. C'est une caractéristique intrinsèque de la technologie. A techno identique, tous les capteurs auront la même sensibilité native. La techno back-light a permis de doubler la sensibilité (approx).
On peut retenir les chiffre suivants (approx) pour les sensibilités natives:
- capteurs anciens 100 ISO (capteurs 1/2.3", APS-C ou FF)
- Capteurs récents 200 ISO (id)
- Capteurs back-lighted 400 ISO (id)

La sensibilité affichée dans nos APN est une sensibilité 'virtuelle'. C'est le résultat d'une amplification. (ce qui a pour inconvénient d'augmenter le bruit de 40% (en réalité de racine de 2) à chaque doublement de la sensibilité.
De même en chimie avec pellicules, on faisait appel à un amplificateur (durée de développement) pour augmenter la sensibilité (au détriment du bruit. Mais on ne raisonnait pas encore comme cela)

Cordialement
Microscopie avec des BHS (dia/epi LPA, fluo, DIC, IR, capteurs) et analyses théoriques (FTM, spectro, ...)
Mes photos de voyages, microscopie et relief http://pichotjm.free.fr/Photos/Photos.php
Racine du site: Description des débuts de l'informatique (lampes, tores, Tr, SSI, LSI, ... ) http://pichotjm.free.fr
Avatar du membre
OlivierBarth
membre
membre
Messages : 630
Enregistré le : 06 oct. 2007 12:29
Prénom : Olivier

Re: amibes test pour mon équipement

Message par OlivierBarth »

Bonjour à tous et bonne année 2021!!!
Merci pour vos commentaires sur le sujet ;)
pour terminer avec les amibes-test, voici 3 spécimens fréquents dans mes prélèvements:
nuclearia2.jpg
nuclearia2.jpg (113.28 Kio) Vu 2930 fois
amibes4.jpg
amibes4.jpg (99.27 Kio) Vu 2929 fois
diplophrys3.jpg
diplophrys3.jpg (87.44 Kio) Vu 2924 fois
microscope trinoculaire Swift, obj 4,10,20,40,100
caméra: 1.3 MP
JMP76
membre
membre
Messages : 1439
Enregistré le : 16 nov. 2011 17:19
Prénom : Jean-Marie
Contact :

Re: amibes test pour mon équipement

Message par JMP76 »

Bonjour à tous, et meilleurs voeux pour cette nouvelle année!

(Juste une remarque, en espérant ne pas irriter)

Olivier, tu devrais mettre des photos plus petites, car il existe des fonctions anti-flou dans les logiciels d'images. Mais ceux-ci demandent, pour fonctionner, d'avoir des détails présents. S'il n'y a ps de variations dans les détails, ils ne peuvent calculer la correction (approchées) à apporter pour compenser le flou.
En gros tes images sont trop floues. En les réduisant cela ne détruit pas l'information présente, mais cela offre des variations dans les détails, ce qui permet de corriger le flou.

Voilà ce qu'on peut obtenir rapidement en diminuant la taille de l'image +anti-flou:
mayorella_sp.jpg
mayorella_sp.jpg (65.57 Kio) Vu 2915 fois
En refaisant un cycle de réduction on peut encore améliorer l'image (mais elle sera plus petite)
mayorella_sp2.jpg
mayorella_sp2.jpg (40.53 Kio) Vu 2917 fois
Mais on finit par croire à une bonne image (et quelle dommage qu'elle ne soit pas plus grande!)

Voilà, voilà.

Cordialement
Microscopie avec des BHS (dia/epi LPA, fluo, DIC, IR, capteurs) et analyses théoriques (FTM, spectro, ...)
Mes photos de voyages, microscopie et relief http://pichotjm.free.fr/Photos/Photos.php
Racine du site: Description des débuts de l'informatique (lampes, tores, Tr, SSI, LSI, ... ) http://pichotjm.free.fr
Répondre

Retourner vers « Protistologie (obs.) »