ImageJ - Traitement d'images

[PAM]

Bonjour à tous

Juste au passage, Regardez-voir le logiciel OpenGl ImageJ http://rsbweb.nih.gov/ij/. De nombreuses contributions sont apportées par une communauté importante. La mise à jour est même désormais automatisée. Je l'utilise de temps à autre pour des applications spécifiques ( tri en fonction de la surface, dénombrement de particules.....)

Amicalement

Pierre

[Eddy]

Bonjour,

C'est un logiciel effectivement très utilisé, y compris au labo pour l'analyse des gels.
Merci de nous faire partager ce lien.

Cordialement,
Eddy

[Siam]

Bonjour,
Pour compléter le message de PAM...
Deux versions de ImageJ ont été développées pour la microscopie et l'imagerie scientifique:

- MBF (pour MacMaster Biophotonics Facility), un centre commun d'une Université canadienne)
De nombreuses améliorations et plugins (stables) pour l'analyse et le traitement de microphotographies.
Téléchargement, manuel et aide (en anglais) ici: http://www.macbiophotonics.ca/imagej/

-FIJI (pour Fiji Is Just ImageJ)
Très complet également, malgré l'acronyme...
Wiki, téléchargement ici: http://pacific.mpi-cbg.de/wiki/index.php/Main_Page (en anglais)

Bonnes observations !

[shrek]

Est-ce que l'un d'entre vous l 'a utilisé en" Stack" ??

jpierre

[JLouis]

Bonjour

Dommage qu'il soit en Anglais
Connnaitriez vous un autres de même type en Français ?
jlouis

[Siam]

Jean-Pierre,
Les stacks sont de simples "piles" d'images, tout dépend ce que vous souhaitez en faire...
Si c'est pour combiner des images prises à différentes positions focales et améliorer la profondeur de champ, il existe plusieurs plugins fonctionnant plus ou moins bien:

-StackFocuser (http://rsbweb.nih.gov/ij/plugins/stack-focuser.html
-Extended Depth of Field (http://bigwww.epfl.ch/demo/edf/, plus complet (démo en ligne à l'adresse suivante: http://bigwww.epfl.ch/demo/edf/applet/index.html)

Jean Louis, pour ce qui est du langage de ImageJ, effectivement ça peut être problématique... J'avais commencé à traduire les menus du programme et de certains plugins, mais j'ai finalement renoncé devant les difficultés (triturer les classes Java n'est pas une mince affaire).

A ma connaissance, il n'y a pas d'équivalent en français d'ImageJ, mais le logiciel ImageAnalyzer de Meesoft est peut-être une alternative qui conviendra à vos besoins. Le logiciel (gratuit) et les traductions additionnelles sont téléchargeables ici: http://meesoft.logicnet.dk/. Des plugins sont également disponibles, mais certains (notamment "Microscopic Imaging", qui contient le module "multifocus") nécessitent un mot de passe, que vous pourrez obtenir en supportant le logiciel (par un don ou... une amélioration des traductions!).

JMicroVision, un autre logiciel gratuit d'analyse et de traitement d'images (malheureusement en anglais), est disponible ici: http://www.jmicrovision.com/index.htm
L'interface est un peu déroutante, mais c'est un logiciel bien conçu et adapté au traitement et à l'analyse des microphotographies (calibration et mesures spatiales, comptage, filtres, ...). Par contre, je ne crois pas qu'il y ait d'opération équivalente au "multifocus".

Sébastien

[JLouis]

Bonjour Siam
Je regarderais ça de plus près. En tout cas merci pour l'info.

[PAM]

Bonjour à tous, retour du Soleil et des beaux clichés.

merci Siam pour ces liens supplémentaires.

Pierre