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Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 26 août 2012 13:33
par BelialL
Salut Jean-Marie,

Il s'agit là d'algues possédant une paroi en silice.

Si tu veux en récolter, tu peux prendre une algue ou frotter la surface des roches afin de récupérer tous ce qui est fixé dessus.
Pour l'algue, tu peux la laisser un peu de temps dans l'eau de Javel et ensuite la comprimer afin de garder le liquide contenant les diatomées qui ont été décrochées.

Le plus compliqué est de nettoyer les prélèvement afin de ne garder que les paroi en silice, il faut détruire toute la matière organique et éliminer les particules.
Cependant, on peut déjà faire plein d'observations - y compris en MEB - sans avoir un échantillon parfaitement propre. Il peut rester quelques débris qui pourront gêner l'observation mais en général on arrive toujours à avoir quelques diatomées bien placées et bien propres.

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 26 août 2012 14:20
par JMP76
Merci pour la réponse, mais il me faut d'autres précisions...
- Frotter: avec le doigt? une brosse, qqs secondes ou minutes? sec ou humide?
- surface des roches: là où il y a des algues? je suppose.
- algues: laminaire ou avec des petites poches d'oxygène, ou genre mousse
- eau de Javel: concentration berlingot, ou diluée? (comme pour un lavage à la main)
- Un peu de temps: 10 s ou 10 mn ?
- nettoyer les prélèvements: "à l'eau de Javel puis lavages et eau oxygénée 35% au bain-marie..."? (comme expliqué)
- y compris en MEB: Il va aussi falloir que je réfléchisse à ne pas polluer une salle blanche de nanotechnologie... au dégazage sous vide très poussé... métallisation?
- observation possible sous banc macro avec reflex? (avec JML 20x)

Je suis désolé pour ces questions mais je suis totalement novice, et un mot utilisé par un biologiste peut être traduit de manière totalement différente par un débutant (dans cette matière).

Cordialement

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 26 août 2012 15:42
par BelialL
JMP76 a écrit : - Frotter: avec le doigt? une brosse, qqs secondes ou minutes? sec ou humide?
Une brosse à dent fait l'affaire, avec un peu d'eau et normalement tu dois voir le biofilm qui est déposé sur la roche se détacher.
JMP76 a écrit : - surface des roches: là où il y a des algues? je suppose.
Il y en a quasiment partout, mais le mieux c'est de prendre les cailloux recouvert d'un peu de boue.
JMP76 a écrit : - algues: laminaire ou avec des petites poches d'oxygène, ou genre mousse
Comme pour les roches, tu trouveras des diatomées sur n'importe quelle algue ou en compressant les mousses.
JMP76 a écrit : - eau de Javel: concentration berlingot, ou diluée? (comme pour un lavage à la main)
Peu importe, le but étant de vider les diatomées de leur contenu cellulaire.
Quelques minutes suffisent, surtout avec le reste du traitement. Mais tu peux la laisser plus longtemps afin de t'assurer que toute les diatomées fixées sur l'algue sont bien détachées.
JMP76 a écrit : - nettoyer les prélèvements: "à l'eau de Javel puis lavages et eau oxygénée 35% au bain-marie..."? (comme expliqué)
Le but est de détruire la matière organique et d'éliminer les particules. Il n'y a pas vraiment de protocole fixe et ça ne fonctionne pas toujours aussi bien selon les prélèvements.
Tout ce que tu peux utiliser pour ça est bon à essayer, cependant, l'eau oxygénée reste une constante en général étant donné qu'il s'agit d'un très puissant oxydant et qu'elle est facilement accessible (7 € le litre en grande surface).
JMP76 a écrit : - y compris en MEB: Il va aussi falloir que je réfléchisse à ne pas polluer une salle blanche de nanotechnologie... au dégazage sous vide très poussé... métallisation?
- observation possible sous banc macro avec reflex? (avec JML 20x)
Pour le MEB je ne peut pas répondre, je ne l'ai jamais utilisé mais il s'agit de morceaux de verre donc on peut travailler sous vide et la métallisation est nécessaire je pense.

Le banc macro va être juste, tu verra les diatomées mais elles seront trop petites pour discerner qui que ce soit. Il faut les observer au microscope.

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 26 août 2012 17:43
par JMP76
Super les réponses. Je vais étudier cela et voir ce que je peux faire. Et puis si ça rate, je recommencerai un autre jour!

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 27 août 2012 11:47
par André
Bonjour à tous, Kevin

J'ai quelques éléments pour les espèces de cette pêche aventureuse ! (tu ne nous dis pas tout! :D )

L'actinoptychus c'est splendens (Shab.) Ralfs
Il me semble deviner une double ponctuation des stries sur la Diploneis....regarder vers D.smithii
Pour Lyrella au vu des aires longitudinales droites sans constriction au centre, c'est- soit une forme recta de L.lyra - soit une L.robertsiana = L.lyra var robertsiana

Les espèces planctoniques sont souvent très fragiles et se dégradent rapidement .

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 27 août 2012 11:57
par BelialL
Salut André,

Merci pour les précisions, je vais regarder tout ça plus en détail. ;)

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 27 août 2012 12:12
par JMP76
Bonjour Kevin,

encore une question (qui va paraitre idiote... désolé)

Quelle quantité faut-il récolter pour avoir des diatomées? 1 litre ou 1 cm3 ?

Cordialement

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 27 août 2012 12:17
par BelialL
Tu peux déjà trouver pas mal de diatomées dans une seule goutte d'eau !

Mais avec le traitement, il y a forcément des pertes à prendre en compte et il vaut mieux en avoir une bonne quantité pour faire plusieurs montage et avoir plus de chance de trouver les rares ! ;)

Après tout dépend de ce que tu récolte, si tu prend bien la vase et les algues que tu dilue dans un peu d'eau, tu vas en avoir beaucoup.
Si tu prend que l'eau de surface, tu en trouveras moins mais tu aura moins de difficultés à les nettoyer ! :D

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 27 août 2012 12:42
par JMP76
Donc qqs petits flacons devraient suffire. Et autant essayer plusieurs méthodes citées. Les traitements sont-ils à faire immédiatement? ou on peut garder cela qqs jours (le temps de rentrer à la maison)

Cela existe-il en eau douce? dans des mares?

Re: Bassin d'Arcachon

Posté : 27 août 2012 12:48
par BelialL
Les traitements peuvent attendre oui.
Pour exemple, ces diatomées du bassin ont attendu pas loin de deux semaines dans le bocal avant que je m'y mette. ;)

Il y a aussi des diatomées en eau douce, un peu partout dans les mares, étangs, rivières,...