Longue de 42 µm sur une largeur de 10.3 µm, cette Navicula pupula possède 20 stries/10 µm, non ponctuées en MO et radiantes. Ces stries très courtes au centre forment un stauros.
Des deux côtés du raphé se trouve une côte qui, ici discrète, est formée par l'extrémité des stries et qui permet de classer cette espèce dans la section Bacillare du genre Navicula.
Les valves sont légèrement enflées au centre et un peu étirées aux extrémités qui sont arrondies.
L'espèce est très polymorphe.
Des deux côtés du raphé se trouve une côte qui, ici discrète, est formée par l'extrémité des stries et qui permet de classer cette espèce dans la section Bacillare du genre Navicula.
Les valves sont légèrement enflées au centre et un peu étirées aux extrémités qui sont arrondies.
L'espèce est très polymorphe.
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