Le Naturaliste

Bonsoir,

J'ai laissé un échantillon d'eau douce quelques semaines dans une bouteille fermée. Pas mal de bactéries se sont développées (on le sait vite à l'odeur en ouvrant la bouteille!).
J'ai fait un très court film (1mn) de l'observation en contraste de phase au 100x en immersion dans l'huile.

Je ne sais pas identifier les organismes à l'écran. Si vous savez mettre des noms sur certains, cela m’intéresse!

Bonne soirée,

Voici quelques tentatives d’identification des membres du casting:

Bactéries:
Vibrios: Spirochète:
Thiospirillum Jenense? Croococcus? Algues:
Diatomée Navicula: Quel est votre avis sur ces tentatives d'identification? En avez-vous identifié d'autres?

Merci,

Bonjour Roland
Le spirochète semble une bonne approche.
Chroococcus , je ne les connais que dans les tourbières . Lors de leur observation aux oculaires , de quelle couleur sont elles ?
Celle de gauche me semble bien ronde .
Oui pour la navicule.

Bonjour André,

Le spirochète semble une bonne approche

Merci. J'hésitais avec Spirella.

Chroococcus,...de quelle couleur sont elles ?

Pas de couleur marquée. Effectivement, ça ne colle pas avec le vert de Chroococcus.
En voilà une autre avec le même mucus mais un seul "noyau"cette fois: Il semble que l'environnement est devenu franchement anoxic. Est-que celles-ci pourraient être des bactéries qui respirent des sulfures? Bonne journée!

Bonsoir Roland, tous,

Ta vidéo est très nette avec un bon contraste de phase, parfait !

J'ai laissé un échantillon d'eau douce quelques semaines dans une bouteille fermée. Pas mal de bactéries se sont développées (on le sait vite à l'odeur en ouvrant la bouteille!).

Quelle est la provenance de cette eau douce ? eau stagnante et polluée, étang, lac ? Si de nombreuses bactéries se développent , c'est qu'elles ont à manger, ce type d'échantillon me rappelle ceux provenant d'une station d'épuration.
L'odeur: est-ce que cette odeur est celle des oeufs pourris ? Si oui, il y a certainement des bactéries du soufre là-dedans.
Au premier coup d'oeil, il me semble bien qu'on a affaire à un environnement anoxique avec des bactéries du soufre.
Ce préambule pour dire que les bactéries ne se laissent pas déterminer par leur forme, à part quelques exceptions et encore sans grande garantie, mais par ce qu'elles sont capables de faire. Pour cette raison, il faut au minimum connaître l'environnement et conditions de croissance.

Maintenant, ce que je peux suggérer:
- Ok pour le spirochète. Probablement des Leptospires qui sont très fins et proviennent souvent d'excrétions d'animaux.

- Les vibrions: Éventuellement, ils sont tordus et bougent avec un mouvement assez caractéristique.
https://www.youtube.com/watch?v=cKWQqID ... D&index=10

- Chroococcus: A mon avis, c'est un organisme amiboïde, zooflagellé mal en point ou autre chose, mais pas une cyanobactérie. Les 1 ou 2 "noyaux" sont plutôt des vacuoles de stockage (leucosine ?).

- les longs et gros filaments pourraient être des Beggiatoa ou similaires - donc des bactéries du soufre.

- Ce que tu prends pour Achromatium oxaliferum n'en est pas. A.oxaliferum est une énOoorme bactérie:
https://www.youtube.com/watch?v=Qioj2w_ ... 6D&index=4

- Le "Thiospirillum jenense" est plus gros et différent. Cette bactérie de ta vidéo me fait plutôt penser à un Caulobacter sp. , que l'on retrouve à 1:01.
https://www.youtube.com/watch?v=wYzvGTc ... 6D&index=6
Un Thiospirillum sp. ou similaire pourrait se trouver à 0:25

- A 0:28, j'ai eu l'impression que tu as une typique bactérie du soufre contenant des granules de soufre élémentaire, mais normalement les granules de soufre sont colorés en contraste de phase. Donc, ces granules contiennent peut-être des polyphosphates.
https://www.youtube.com/watch?v=NlNT9dv ... D&index=16

En espérant ne pas avoir écrit trop de bêtises...

Merci Bernard pour toutes ces informations. Tes films sont magnifiques. Je n'ai pas fini d'apprendre en parcourant ta chaîne!

Quelle est la provenance de cette eau douce ?

Mon échantillon vient d'une source qui alimente un petit bassin où les chiens des promeneurs viennent régulièrement se baigner. J'ai prélevé du sédiment et des algues avec. Il contenait au départ des gammares, des ciliés, des rotifères. Tout ce monde a du se décomposer et produire le souffre qui lui a donné son odeur (ça sent bien l’œuf pourri).

Je ne connais rien aux bactéries et des sources d'informations simples ne sont pas évidentes à trouver pour un amateur novice comme moi. Je vais potasser tes vidéos!